A chaque fois que Mega Man anéantit un boss, il récupère son arme spéciale. Pour vous servir d’une arme spéciale, appuyez sur pour mettre le jeu en pause et afficher l’écran de sélection de l’arme. Faites votre sélection avec , puis pressez pour confirmer. Chaque arme dispose de sa propre jauge, qui peut être remplie quand Mega Man trouve une recharge.
Note: il n’est pas nécessaire de recharger l’arme standard.