Naast je vuisten heb je verschillende wapens tot je beschikking – maar je zult ze eerst moeten vinden. Wapens zijn te vinden in tassen, kleipotten of soms zelfs vol in het zicht. Om een wapen te pakken gebruik je je vuisten of je zweep om een pot of een tas open te breken en loop je over het wapensymbool heen dat verschijnt. Als je een level niet haalt verlies je al je wapens, met uitzondering van één granaat.

Granaat	Als dit ontploft, worden alle vijanden op het scherm vernietigd. Je begint met één granaat.
Zweep	Dit is hét wapen bij uitstek om vijanden ervan langs te geven en over lavakuilen, poelen vol piranha’s en andere schijnbaar onoverkomelijke obstakels te slingeren.
Pistool	Met dit wapen kun je schieten. Het is minder krachtig dan de zweep, maar heeft een groter bereik.

In de levels zijn items verspreid. Loop over de items heen om ze te pakken.

Gezondheid	Pak deze op om een deel van je gezondheidsmeter te herstellen.
Kristal	Verzamel 100 kristallen om een extra leven te verdienen.
Extra leven	Hiermee krijgt Indy een extra leven.