Nachdem du den Endgegner einer Stage besiegt hast, erhältst du seine Spezialwaffe.

Zur Auswahl von Waffen oder Waffenteilen drücke , um den Waffen-Auswahlbildschirm aufzurufen. Verwende zur Auswahl der Waffe, die du einsetzen möchtest, und bestätige deine Auswahl mit (oder drücke und auf dem Spielbildschirm). Wenn du eine Spezialwaffe benutzt, verringert sich deine Waffen-Energie. Sie wird jedoch wieder aufgefüllt, wenn du die Stage wechselst.

Hinweis:
- Drücke bei der Waffenauswahl gleichzeitig und , um zum X-Buster zurückzuwechseln.
- Um eine bereits absolvierte Stage zu verlassen, wähle auf dem Waffen-Auswahlbildschirm EXIT (Verlassen) mithilfe von aus.

Armteile	Das Ausrüsten dieses Power-Ups ermöglicht dir das Abfeuern eines Doppel-Aufladeschusses mit dem X-Buster. Halte gedrückt und lasse wieder los, um einen Schuss abzufeuern. Drücke erneut für einen weiteren Schuss. Wenn du eine Spezialwaffe ausgerüstet hast, kannst du ebenfalls gedrückt halten und loslassen, um eine Spezialattacke auszuführen.
Panzerrüstung	Wenn du diese Rüstung findest, wird der Schaden, den du von manchen gegnerischen Geschossen nimmst, angesammelt und kann von X eingesetzt werden, um eine gewaltige Giga-Vernichter-Attacke auszuführen. Wenn die Energieanzeige für diese Waffe voll ist, wähle auf dem Waffen-Auswahlbildschirm G.CRUSH (Giga-Vernichter) aus und drücke , um einen Angriff auszuführen, der jedem Gegner auf dem Bildschirm Schaden zufügt. Hinweis: Die Panzerrüstung verringert außerdem den von dir genommenen Schaden.
Item-Sucher	Mit diesem Power-Up kannst du versteckte Elemente in den Stages finden. Wähle auf dem Waffen-Auswahlbildschirm I.TRACER (Item-Sucher) aus und drücke in einer Stage , um es zu benutzen. Eine Zielmarkierung zeigt dir sodann in der Nähe verborgene Wege und Items an (deine Waffen-Energie verringert sich hierdurch nicht).
Luft-Sprint	Durch das Ausrüsten dieses Power-Ups erhältst du die Fähigkeit, einen Sprint in der Luft hinzulegen. Drücke zweimal oder , um durch die Luft zu sprinten. Du kannst den Luft-Sprint einsetzen, um Orte zu erreichen, die du mit einem normalen Sprung nicht erreichen kannst.

Hinweis: Nach Erhalt der Armteile- und Luft-Sprint-Power-Ups kannst du Leitern schneller hinauf- und hinunterklettern.